第一个区别是不同的保护率北京生物新冠肺炎疫苗是对所有年龄组患者的有效率约为80%接种疫苗的四周后，病毒的综合抗体接近100%。接种北京科兴疫苗可预防接种者大约60%的问题，接种疫苗后的四周，预防感染率高达95%，预防死亡率为100%。
第二个区别是制造商不同从名称上可以看出科兴疫苗来自有限公司，而北京生物科技是由中国生物科技北京生物制品研究所有限公司提供。
第三个区别是批准上市的时间不同北京科兴疫苗是2021年2月推出的，已获得了大量研究以及试验的批准，并获得了药品监督管理批准，北京生物疫苗是2020年12月份上市被充分认定为首批进入市场的疫苗。
第四个区别是安全性不同根据中国医药集团的综合分析，新冠肺炎疫苗是高度灭活的，接种两针疫苗之后，患者身体产生高低度抗体，总体抗体阳性转化率接近100%，未发现严重的不良反应安全性高。
